ИБК РАН
  

Поиск

Яндекс метрика

Яндекс.Метрика

Оптимизация ресурса

Лаборатория молекулярной физиологии клетки

Заведующий лабораторией: Колесников Станислав Сергеевич, д.б.н., проф. (т. 121)

Основные направления научных исследований:

  • Изучение сигнальных процессов, протекающих в клетках при их возбуждении.
    Включает:

    1) изучение рецепторных систем и сопряженных сигнальных каскадов (подробнее...)
    2) изучение ионных каналов, вовлеченных в сигнальные процессы (подробнее...)
    3) изучение профиля экспрессии рецепторных, канальных и других сигнальных белков (подробнее...)
    4) математическое моделирование сигнальных и транспортных процессов
    (подробнее...)
  • Реконструкция клеточных компонент в модельных системах.
    Включает:
    1) клонирование сигнальных и канальных белков и их исследование в гетерологичной системе (подробнее...)
    2) исследование бактериальных токсинов и других мембранотропных соединений в модельных липидных мембранах (подробнее...)
    3) разработка биосенсоров (подробнее...)
  • Исследование механизмов молекулярного узнавания.
    Включает:
    1) изучение белок-белкового взаимодействия методами молекулярного моделирования и молекулярной графики (подробнее...)
    2) анализ взаимодействия рецептор-лиганд методами физической и вычислительной химии (подробнее...)

Используемые методы и подходы

  • Электрофизиология (patch clamp, микроэлектродное отведение): регистрация ионных токов и активности одиночных каналов на мембране клеток.
  • Фотометрия: мониторинг динамики Са2+ Mg2+, H+ в цитоплазме одиночных клеток с помощью флуоресцентных зондов.
  • Ингибиторный анализ: изучение вклада различных сигнальных каскадов в исследуемые внутриклеточные процессы с использованием агонистов/антагонистов рецепторов, ингибиторов/активаторов ферментов и блокаторов ионных каналов.
  • Методы молекулярной биологии (RT PCR, RNA amplification, клонирование): анализ экспрессии сигнальных белков на уровне транскриптов в тканях и в одиночных клетках. Клонирование сигнальных и канальных белков с последующей экспрессией и исследованием в гетерологичной системе.
  • Культура клеток: трансфекция клеток в культуре с использованием соответствующего вектора для исследования функциональных свойств рекомбинантных сигнальных и канальных белков; создание биосенсоров.
  • Математическое моделирование: моделирование сигнальных процессов в клетках для оценки вклада отдельных сигнальных белков в динамические свойства сигнальных каскадов.
  • Молекулярная механика и квантовая химия –моделирование движения атомов в молекуле для нахождение вероятных структур молекул путем минимизации энергии. Вычисление распределения электронов в молекуле путем решения уравнения Шредингера для электронов при фиксированных положениях ядер атомов. Расчеты электростатических потенциалов, энергий взаимодействия, распределения гидрофобных участков по поверхности молекулы. Расчет пространственной структуры белка на основе известной структуры гомологичного белка.

Темы для дипломных, магистерских и аспирантских работ.

Специальности: Биофизика, физиология, молекулярная биология