ИБК РАН
  

Поиск

Яндекс метрика

Яндекс.Метрика

Оптимизация ресурса

Баннеры

Центр коллективного пользования Федерального исследовательского центра
«Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук»

Сектор Геномных исследований

 

Организация: Институт биофизики клетки Российской академии наук - обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» (сокращенно - ИБК РАН)
Юридический адрес
: 142290, Пущино Московской обл., пр. Науки, 3
Фактический адрес сектора
: 142290, Пущино Московской обл., ул. Институтская, 3, новый корпус
Контакты: Телефон: (4967) 73-05-19, Факс: (4967) 33-05-09, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Адрес ЦКП в сети Интернет: ЦКП ПНЦБИ РАН, ЦКП №670266
Руководитель сектора: Шавкунов Константин Сергеевич.
Контактное лицо: Шавкунов Константин Сергеевич, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. , тел. 8(4967)739140
Адрес для подачи заявки: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.   Подать заявку он-лайн

Информация о Секторе геномных исследований ЦКП ПНЦБИ РАН

Секвенатор Основным направлением деятельности группы является проведение исследований, направленных на расшифровку полных нуклеотидных
последовательностей геномов отдельных микроорганизмов, метагеномов бактериальных сообществ, изучение видового разнообразия
микробных сообществ по гену 16S рРНК, а также секвенирование транскриптомов прокариотических микроорганизмов.

 

Основное оборудование

  • Система анализа последовательностей ДНК DNBSEQ-G50RS (MGI Tech., Китай)
    Технические характеристики: Максимальный выход за запуск: до 150 Гб; Количество прочтений за запуск на одну ячейку: до 500 млн;
    Характер прочтений: Одноконцевые (SE), Парноконцевые (PE); Мин. длина прочтения: от 50; Макс. длина прочтения: до 150;
    Длительность секвенирования: ˂48 часов; Точность прочтения каждого фрагмента для ˃85% прочтений: 99,90%.
    Назначение: Таргентное секвенирование ДНК и РНК, секвенирование малых геномов, метагеномный анализ.


      Журнал загрузки секвенатора DNBSEQ-G50RS         Бронирование времени работы на приборе         Инструкция по бронированию

 

Услуги сектора

  • Подготовка библиотек геномной ДНК и кДНК с последующим секвенированием.
  • Первичная обработка данных и сборка прочтений в контиги.


Подать заявку

        On-line форма заявки       Статус поданных заявок       Помощь в заполнении заявки





Центр коллективного пользования Федерального исследовательского центра
«Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук»

Сектор оптической микроскопии и спектрофотометрии

 

Организация: Институт биофизики клетки Российской академии наук - обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» (сокращенно - ИБК РАН)
Юридический адрес: 142290, Пущино Московской обл., пр. Науки, 3
Фактический адрес сектора: 142290, Пущино Московской обл., ул. Институтская, 3, Новый корпус ИБК РАН
Контакты: Телефон: (4967) 73-05-19, Факс: (4967) 33-05-09, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Адрес ЦКП в сети Интернет: ЦКП ПНЦБИ РАН, ЦКП №670266
Руководитель сектора: и.о. зав. Лаборатории методов оптико-спектрального анализа в.н.с. д.ф.-м.н. Пеньков Никита Викторович.
Контактное лицо: в.н.с. д.ф.-м.н. Пеньков Никита Викторович, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. , тел.: +7(4967)739204
Адрес для подачи заявки: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. Подать заявку он-лайн

 

Основные направления научных исследований

    • Определение уровня секреции и мембранной экспрессии белков теплового шока (БТШ 90) в опухолевых клетках методами иммуноцитохимии в приложении к задачам исследования участия стрессовых белков в регуляции инвазии и миграции злокачественных клеток и поиска новых антиметастатических препаратов.
    • Тестирование функциональной активности регуляторных областей генов прокариот в составе репортерных векторных конструкций, содержащих гены флуоресцентных белков EGFP mCherry, определение относительной эффективности противонаправленных бактериальных промоторов, в том числе, контролирующих синтез некодирующих РНК.
    • Определение уровня экспрессии мембранных белков микроорганизмов в конструкциях трансляционного слияния с генами флуоресцентных белков.
    • Исследование протекторных эффектов модифицированных ферментов-антиоксидантов и противоотечных пептидов при ишемически-реперфузионных поражениях внутренних органов.
    • Исследование эффективности радиопротекторов при действии ионизирующего излучения в сублетальных и летальных дозах.
    • Исследование нервной и мышечной ткани плоских червей.
    • Клеточные механизмы нейроглиальных взаимодействий в мозге.
    • Молекулярные механизмы нейродегенерации при нарушении экспрессии транскрипционных факторов в коре мозга.
    • Молекулярные механизмы повреждения клеток мозга при ишемии и разработка способов защиты.
    • Разработка методов селективной защиты определенных популяций ГАМКергических нейронов, управляющих нейрональной сетью, от гипервозбуждения при эпилептиформной активности.
    • Методы иммуноцитохимии и иммуногистохимии - регистрация флуоресценции антител.
    • Витальный кальциевый нейроимиджинг, регистрация продукции АФК в митохондриях и цитлзоле.
    • Разработка клеточных моделей - биосенсоров, удобных для спектральных исследований, которые могут найти применение в фармакологии, медицине и экологии.

 

Основное оборудование

  • Проточный цитофлуориметр CytoFlexS (Beckman, Китай)
    Технические характеристики: Комплектация - B2-R0-V4-Y4-NUV2. Источники излучения: полупроводниковый лазер 375 нм, 405 нм, 488 нм и 561 нм; количество каналов детекции флуоресценции: до 12 одновременно (2 для 375 нм, 4 для 405 нм, 2 для 488 нм и 4 для 561 нм); минимальный размер определяемых частиц: до 200 нм (с использованием бокового светорассеяния от лазера 405 нм); чувствительность: FITC: до 30 MESF, PE: до 10 MESF""; скорость регистрации событий: до 30 000 соб./с.
    Назначение: Анализ состояния клеток при проведении исследований по изучению механизмов индукции противовирусного и противоопухолевого иммунитета.
  • Конфокальный инвертированный микроскоп Leica TCS SP5 (Leica, Германия)
    Технические характеристики: Возбуждение лазерами He-Ne 543, 633 nm; Ar 458, 476, 488, 496, 514 nm.
    Режимы измерения: фазовый контраст, ДИК, пропускание, отражение.
    Объективы: HC PL Apo 10x/0.4; HC PL Apo 20x/0.7; HCX PL Apo 40x/1.25; HCX PL Apo 63x/1.3; HCX PL Apo 63x/1.4.
  • Широкопольный прямой микроскоп Axio Imager.Z1 (Carl Zeiss, Германия)
    Технические характеристики: Флуоресцентный микроскоп с возбуждением линиями ртутной лампы.
    Объективы: Plan Apochromat 40x/0.95; IR-Achroplan 63x/0.9; EC Plan-Neofluar 5x/0.16; Plan Apochromat 63x/1.4.
    Цифровая скоростная камера С10600-10В-Н (Hamamatsu).
  • Широкопольный прямой микроскоп Leica DM 6000 B (Leica, Германия)
    Технические характеристики: Флуоресцентный микроскоп с объективами: 2.5x, 5x; 63x; 10 PH1; 40 PH2; 100 PH3; HCX PL Fluotar 20x/0.5.
    Цифровая камера DFS420C (Leica).
  • Широкопольный инвертированный микроскоп Axio Observer.Z1 (Carl Zeiss, Германия)
    Технические характеристики: Флуоресцентный микроскоп с возбуждением линиями ртутной лампы и диодными лазерами.
    Объективы: N-Achroplan 5x/0.13; N-Achroplan 10x/0.25; LD Plan-Neofluar 20x/0.4; LD Plan-Neofluar 40x/0.6; LD Plan-Neofluar 63x/0.75.
    Цифровая скоростная камера (Hamamatsu).
  • Спектрофлуориметр Lumina (Thermo, США)
    Технические характеристики: Спектральный диапазон: 190-900; Спектральное разрешение: 0,5 нм; Скорость сканирования 1000 нм/мин.
  • Спектрофотометр Evolution 600 UV-VIS (Thermo, США)
    Технические характеристики: Спектральный диапазон: 190-900; Спектральная ширина щели: 0.2 нм.

Вспомогательное борудование

  • Установка для очистки воды MilliQ (Millipore, США)
    Технические характеристики: Чистота производимой воды, по критерию удельного сопротивления 18,2 МОм*см.
    Фильтрация частиц с размером более 0,2 мкм.
  • Вибротом Leica VT 1200 S (Leica, Германия)
    Технические характеристики: Толщина срезов: 1 – 1000 мкм. Скорость резки: 0,01 – 1,5 мм/с.
    Применение: приготовление переживающих и химически фиксированных биологических тканей.
  • Микротом Microm HM 325 (Thermo, США)
    Технические характеристики: Толщина срезов: 0,5 – 60 мкм.
    Применение: приготовление гистологических срезов тканей.
  • Криотом 620 E (Thermo, США)
    Технические характеристики: Толщина срезов: 1 – 20 мкм.
    Применение: приготовление криосрезов тканей.


    Дополнительные сведения об оборудовании, включая подробные характеристики приборов, наименование производителя, год выпуска и
    сведения о метрологическом обеспечении доступны по ссылке Оборудование ЦКП на основной странице ЦКП ПНЦБИ РАН в разделе Документы регламентирующие деятельность ЦКП.

Журнал загрузки оборудования сектора

      Журнал загрузки Leica TCS SP5         Бронирование времени работы на приборе         Инструкция по бронированию

 

Услуги сектора

  • Приготовление переживающих срезов (слайсов) ткани.
  • Иммуноцито- и иммуногистохимическое окрашивание препаратов.
  • Иммуно-флуоресцентная регистрация уровня секреции и мембранной экспрессии белков эукариот и микроорганизмов.
  • Регистрация продукции активных форм кислорода митохондрий и цитозоля.


Подать заявку

        On-line форма заявки       Статус поданных заявок       Помощь в заполнении заявки      

!- Пример заявки -->






Центр коллективного пользования Федерального исследовательского центра
«Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук»

Сектор источников ионизирующих излучений

 

Организация: Институт биофизики клетки Российской академии наук - обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» (сокращенно - ИБК РАН)
Юридический адрес
: 142290, Пущино Московской обл., пр. Науки, 3
Фактический адрес сектора
: 142290, Пущино Московской обл., ул. Институтская, 3, Корпус Источников ионизирующих излучений
Контакты: Телефон: (4967) 73-05-19, Факс: (4967) 33-05-09, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Адрес сайта в сети Интернет: ЦКП ПНЦБИ РАН, ЦКП №670266
Руководитель сектора: с.н.с. д.б.н. Моренков Олег Сергеевич, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Контактное лицо: Писаков Анатолий Владимирович, Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. , тел.: +7(4967)733750
Адрес для подачи заявки: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.  

 

Основные направления научных исследований

    • обеспечение исследований в области радиобиологии;
    • изучение действия малых доз ионизирующего излучения на биообъекты;
    • изучение действия хронического облучения в малых дозах на жизнедеятельность биообъектов;
    • изучение повреждающего действия и отдаленных последствий ионизирующего излучения;
    • тестирование радиопротекторных соединений.

 

Основное оборудование

  • Рентгеновская установка РУТ-250-15-1 (СССР, Мосэнерго, 1967)

 

Услуги сектора

    • Дозиметрия.
    • Рентгеновское облучение животных, растений, культур клеток и тканей.





Центр коллективного пользования Федерального исследовательского центра
«Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук»

Уникальная научная установка

Флуоресцентная станция Axio Observer Z1 со встроенным микроинкубатором, электрофизиологической установкой «patch clamp», оснащенная камерой Hamamatsu ORCA-Flash

 

Базовая организация: Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт биофизики клетки Российской академии наук (ИБК РАН)
Юридический адрес: 142290, Пущино Московской обл., пр. Науки, 3
Фактический адрес: 142290, Пущино Московской обл., ул. Институтская, 3
Контакты: Телефон: (4967) 73-05-19, Факс: (4967) 33-05-09, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Адрес УНУ в сети Интернет: ЦКП ПНЦБИ РАН, УНУ №445679
Руководитель УНУ: зав. лаб. д.б.н. проф. Зинченко Валерий Петрович, тел. (4967) 739162 e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. факс: (4967) 330509 (для Зинченко)
Контактные лица: к.б.н., н.с. Надеев Александр Дмитриевич (заявки, документооборот) тел. (4967) 739125 e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. ; к.б.н., н.с. Теплов Илья Юрьевич (основной оператор, научные консультации, заявки) тел. (4967) 739125 e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.

Описание и уникальные характеристики

axioobzДанная установка представляет собой флуоресцентный микроскоп, совмещенный с электрофизиологической установкой «patch clamp». То есть обладает широкими возможностями флуоресцентного микроскопа, а именно позволяет исследовать разнообразные внутриклеточные параметры, такие как концентрация внутриклеточного кальция, митохондриальный и клеточный мембранный потенциал, внутриклеточный уровень pH и многие другие. Благодаря встроенному микроинкубатору исследования можно проводить не просто на живых клетках, а в условиях максимально близких к физиологическим.

Кроме того, благодаря установленной камере Hamamatsu ORCA-Flash 2.8 данный микроскоп обладает рядом уникальных преимуществ. Камера является высокоскоростной, что позволяет получать данные о быстроменяющихся клеточных параметрах и использовать двухволновые флуоресцентные зонды. Также данная камера является высокочувствительной и обладает высоким разрешением, что позволяет регистрировать даже незначительные изменения флуоресценции. Компьютерная система визуализации изображений позволяет в реальном времени наблюдать изменения клеточных параметров в нескольких сотен клеток.

При этом флуоресцентная станция оснащена электрофизиологической установкой «patch clamp». Методология «patch clamp», или методика «локальной фиксации мембранного потенциала» позволяет исследовать электрофизиологические параметры клетки, измерять трансмембранные токи и мембранные потенциалы, что особенно важно для исследования электровозбудимых клеток.

Описываемая установка позволяет одновременно исследовать как электрофизиологические параметры живых клетки, так и с высокой чувствительностью определять множество других клеточных параметров с использованием флуоресцентных методов.

В России приборов совмещающих возможности флуоресцентного микроскопа и «patch clamp» установки находится всего несколько штук, а уникальная современная конфигурация, в первую очередь наличие высокоскоростной камеры позволяют проводить самые современные комплексные исследования процессов, происходящих на субклеточном, клеточном и тканевом уровне.

Дополнительные сведения об оборудовании, включая подробные характеристики приборов, наименование производителя, год выпуска и сведения о метрологическом обеспечении доступны по ссылке Оборудование ЦКП на основной странице ЦКП ПНЦБИ РАН в разделе Документы регламентирующие деятельность ЦКП.

Решаемые с использованием УНУ масштабные научные задачи

Флуоресцентная микроскопия – один из основных методов клеточной биологии. С использованием различных флуоресцентных зондов возможно изучение механизмов нормальных и патологических процессов, происходящих на клеточном уровне в абсолютно всех типах клеток. Использование метода «patch clamp» также позволяет исследовать электрофизиологические характеристики различных типов клеток. Таким образом, данная установка может использоваться для решения широчайшего спектра задач клеточной биологии, как фундаментального, так и прикладного характера. Одновременное измерение многих параметров живых клеток позволяет достаточно полно охарактеризовать их состояние и выявить локализацию нарушений метаболизма и внутриклеточных сигнальных путей при различных патологиях. В частности, сотрудники лаборатории, института, а также сотрудники других учреждений проводят следующие исследования.

  • Установление корреляционных отношений между оптическими и электрофизиологическими параметрами отдельных популяций нейронов позволило: а) предложить новую дополнительную систему классификации подтипов нейронов; б) выявить популяции нейронов, селективно гибнущие при гипервозбуждении и ишемии мозга. Это дает возможность поиска механизмов протекции этих клеток от неблагоприятных факторов.
  • Изучение механизмов регуляции сокращения кардиомиоцитов. Исследование сигнальных путей и ионных каналов в сердечных клетках лежит в основе разработки лекарственных средств и препаратов, необходимых для коррекции нарушений возбудимости, проводимости, сократимости и автоматизма сердечной мышцы. При проведении исследований на электровозбудимых клетках можно наиболее полно использовать все уникальные возможности данной установки, однако данная установка используется и для проведения исследований на других типах клеток, в частности
  • Исследование механизмов внутриклеточной передачи сигнала в адипоцитах крайне важно для понимания процессов происходящих при ожирении диабете II типа.

Основные полученные значимые научные результаты и публикации

  • С использованием «УНУ» получены уникальные результаты о свойствах различных субпопуляций нейронов в культуре, что дает возможности развития новейших терапевтических стратегий. В частности было показано, что при гипоксии происходит гипервозбуждение и последуюшая гибель в первую очередь тормозных ГАМКергических нейронов. Причиной селективной гибели является недостаточность PI3 киназного защитного пути. Активация PI3K-зависимого сигнального пути выживания нейронов этого типа является возможной стратегией защиты этих клеток от гипоксии. (Exp. Neurol. 2013 Dec; 250:1-7. Short-term episodes of hypoxia induce posthypoxic hyperexcitability and selective death of GABAergic hippocampal neurons. Turovskyу et al.)
  • Показано экстраординарное протективное действие цитокина IL-10 при ишемии клеток гиппокампа в культуре и при ишемическом инсульте in vivo . При этом защитное действие IL-10 связывается с активацией PI3K-киназного сигнального пути в интернейронах. (Neurosci. Lett. 2014 Jun 13; 571:55-60. Anti-inflammatory cytokine interleukin-10 increases resistance to brain ischemia through modulation of ischemia-induced intracellular Ca²⁺ response. Turovskaya et al.)
  • В исследованиях механизмов печеночных энцефалопатий показано, что основной токсический агент ионы аммония вызывают гипервозбуждение нейронных сетей. Гипервозбуждение происходит с участием ионотропных глутаматных рецепторов типа NMDA. Токсичность ионов аммония предотвращалась активацией различных ингибирующих рецепторов. Полученные данные позволили предложить стратегию подавления гипервозбуждения активацией различных ингибирующих рецепторов, вместо стратегии применения ингибиторов ферментов или антагонистов возбуждающих рецепторов. (PLoS One. 2015 Jul 28; 10(7):e0134145 To Break or to Brake Neuronal Network Accelerated by Ammonium Ions? Dynnik et al.)
  • Гипервозбуждение нейронов при действии аммиака наблюдается в первую очередь в определенном подтипе ГАМКергических нейронов, содержащих Са2+-связывающие белки (кальбиндин). Кофермент NAD селективно ингибировал гипервозбуждение в этом подтипе ГАМКергических нейронов, и это ингибирование сопровождается рассинхронизацией колебаний и диссоциацией нейронной сети на несколько популяций нейронов. (Биологические Мембраны, 2016, том 33, № 2, с. 1–9. NAD вызывает диссоциацию нейронных сетей на субпопуляции нейронов, подавляя синхронную гиперактивность сетей, индуцированную ионами аммония. Зинченко и др.)
  • Показано несколько новых механизмов регуляции синхронной активности нейронов в культуре клеток гиппокампа ГАМК-ергическими нейронами, содержащими Са -связывающие белки. (Биофизика, 2015, том 61, № 1, с. 102-11. Парвальбумин-содержащих интернейронов в регуляции спонтанной синхронной активности нейронов мозга в культуре. Зинченко и др.)
  • Изучены особенны бупивакаин-чувствительных калиевых токов. (Biochemistry (Moscow) Supplement Series A: Membrane and Cell Biology October 2015, Volume 9, Issue 4, p. 309-17. Identification and properties of bupivacaine-sensitive potassium currents in cultured hippocampal neurons. Konakov et al.)
  • На кардиомоцитах исследованы особенности сигнальных путей, активируемых α2- адренорецепторами. Показано, что нарушения этих сигнальных путей могут быть связаны с сердечной гипертрофией. (J. Mol. Cell Cardiol. 2016 Sep 19;100:9-20. Sarcolemmal α2-adrenoceptors control protective cardiomyocyte-delimited sympathoadrenal response. Kokoz et al.)
  • Исследованы механизмы кальциевой сигнализации в адипоцитах при действии ангиотензина II. Полученные результаты предоставляют возможность использовать ангиотензин II для коррекции резистености адипоцитов при развитии диабета второго типа. (Arch Biochem Biophys. 2016 Mar 1; 593:38-49. Angiotensin II activates different calcium signaling pathways in adipocytes. Dolgacheva et al.)
  • Показано, что при оверэкспрессия нейронами белка BDNF оказывает комплексное нейропротективное действие на нейроны и астроциты при OGD и GluTox посредством ингибирования ответов Ca2+ и регуляции экспрессии генов. (Int J Neurosci. 2020 Apr;130(4):363-83. The selective BDNF overexpression in neurons protects neuroglial networks against OGD and glutamate-induced excitotoxicity. Gaidin et al.)
  •  
    Кальциевый сигнал, индуцированный дофамином, может стимулировать высвобождение нейромодуляторов, таких как ГАМК и адреналин, и, таким образом,
    подавлять спонтанные кальциевые колебания в нейронах. (Cell Calcium. 2021 Mar;94:102359. Dopamine controls neuronal spontaneous calcium oscillations via astrocytic signal. Berezhnov et al.)
  •  
    Показано, что кальциевые каналы L-типа способствует поддержанию необходимого уровня внутриклеточного кальция во время колебаний, что, по-видимому, определяет количество PDS в кластере. (Int J Mol Sci. 2021 Sep 25;22(19):10342. Role of L-Type Voltage-Gated Calcium Channels in Epileptiform Activity of  eurons. Laryushkin et al.)

{jcomments on}

Центр коллективного пользования Федерального исследовательского центра
«Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук»

Сектор электронной микроскопии

 

Организация: Институт биофизики клетки Российской академии наук - обособленное подразделение Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Пущинский научный центр биологических исследований Российской академии наук» (сокращенно - ИБК РАН)
Юридический адрес
: 142290, Пущино Московской обл., пр. Науки, 3
Фактический адрес сектора
: 142290, Пущино Московской обл., ул. Институтская, 3, Корпус Института биофизики клетки
Контакты: Телефон: (4967) 73-05-19, Факс: (4967) 33-05-09, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
Адрес ЦКП в сети Интернет: ЦКП ПНЦБИ РАН, ЦКП №670266
Руководитель сектора: руководитель Лаборатории методов электронной микроскопии в.н.с. к.б.н. Рогачевский Вадим Валерьевич.
Контактное лицо: Рогачевский Вадим Валерьевич, e-mail: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра. , tel. +79161881893
Адрес для подачи заявки: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.   Подать заявку он-лайн


Информация о Секторе электронной микроскопии ЦКП ПНЦБИ РАН

ЦКП фото 3Основным направлением деятельности группы является обеспечение организационных и технических возможностей для широкого использования методов электронно-микроскопического анализа в организациях г. Пущино и Московской области. Деятельность Группы реализуется в форме выполнения НИР и оказания аналитических и образовательных услуг исследователям и научным коллективам, заинтересованным в применении методов электронной микроскопии для выполнения многопрофильных междисциплинарных исследований в области фундаментальной и прикладной биологии и биомедицины, включая клинические и фармацевтические исследования. Группа оказывает типовые и комплексные услуги по выполнению электронно-микроскопических исследований, обеспечивает повышение квалификации специалистов в области электронной микроскопии.

Основные направления научных исследований

  • рецепция, межклеточная и внутриклеточная сигнализация, ультраструктурные основы межклеточных коммуникаций;
  • молекулярные механизмы клеточных патологий, в том числе – нейродегенеративных заболеваний;
  • исследование надмолекулярных комплексов биомакромолекул, отвечающих за реализацию генетической информации, биосинтез белка,
    упаковку генетического материала;
  • выявление ультраструктурных изменений клеток под действием повреждающих факторов физической и химической природы.

Материально-техническая и информационная база

Для проведения полного цикла электронно-микроскопического исследования Сектор электронной микроскопии ЦКП ПНЦБИ РАН предоставляет пользователям специально оборудованные помещения Лаборатории методов электронной микроскопии со следующим оборудованием и материалами:

1) для пробоподготовки – холодильники, вытяжные шкафы, весы, термостаты, мешалки для растворов и заливочных сред, адаптированную для пробоподготовки микроволновую печь, приспособления для получения тонких пленок, установки для напыления углерода и тяжелых металлов, замораживания-скалывания-травления, установка тлеющего разряда, установки для получения сжиженного азота, сосуды Дюара, стереомикроскопы, ультрамикротомы, в том числе крио-ультрамикротом, станки для приготовления стеклянных ножей для ультрамикротомии, а также ряд приборов и приспособлений, необходимых для подготовки образцов, лабораторная, в том числе одноразовая посуда, реактивы и материалы для пробоподготовки;

2) для микроскопии – световые микроскопы, в том числе сканирующий световой микроскоп, оборудованный цифровой камерой, электронный микроскоп высокого разрешения;  

3) для обработки микрофотографий и морфометрического анализа – высокопроизводительное вычислительное оборудование с программным обеспечением для автоматизированной обработки микрофотографий на основе машинного зрения и искусственного интеллекта, лицензионное и свободно распространяемое программное обеспечение, необходимое для проведения морфометрии и трехмерной (3D) реконструкции на световом и электронно-микроскопическом уровне.

4) специализированные информационные источники и литература, включающие: описание методов подготовки материала к исследованию и возможные артефакты, обусловленные  пробоподготовкой; описание ультраструктуры исследуемых объектов в норме, патологии, эксперименте; описание методов количественного анализа ультраструктуры, в том числе на основе 3D реконструкции биообъектов,  с использованием передовых цифровых технологий. Полнотекстовый доступ к информационной базе для авторизованных пользователей реализован через прокси-сервер Лаборатории методов электронной микроскопии на интернет ресурсе synapsis.ru в разделе "Книга под рукой".

На базе сектора и Лаборатории методов электронной микроскопии ИБК РАН собрана уникальная коллекция образцов органов и тканей животных и растений с детальным писанием проведенных с ними поведенческих и электрофизиологических, фармакологических и других экспериментов с 1990-х гг. по настоящее время, что позволяет проводить пилотный анализ ультраструктуры до проведения масштабных экспериментальных работ.

Основное оборудование

  • Микроскоп электронный просвечивающий JEM-1400+, JEOL (Япония) оборудован аппаратно-программным комплексом для захвата и обработки изображений
    Технические характеристики: Полюсный наконечник высокого контраста. Разрешение по точкам – 0,38 нм, по линиям– 0,2 нм. Ускоряющее напряжение 10 – 120 кВольт. Увеличения: ×10 – ×1000; ×300 – ×1500000. Основные режимы наблюдения: высокий контраст, высокое разрешение, темное поле, дифракция. Держатели: стандартный держатель и держатель с большим наклоном. Микроскоп оборудован цифровой камерой осевого монтирования AMT, 43 Мп.

Вспомогательное оборудование

  • Микроскоп световой сканирующий, Axio Imager М1, Carl Zeiss (Германия)
    Технические характеристики: диапазон увеличений от 100 до 1000 крат, объективы EC Plan-NEOFLUAR 10×; 20×; 40×; 63× (иммерсия); 100× (иммерсия).
  • Микроскоп световой фазово-интерференционный, Peraval-Interphako, Carl Zeiss (Германия)
    Технические характеристики: Диапазон увеличения от 50 до 1260 крат; объективы Planachomat: 4×; 6,3×; E 10×; 25×; HI 100× (иммерсия).
  • Ультрамикротом с крио-камерой Leica EM UC6, Leica EM FC6, Leica Microsystems (Австрия)
    Технические характеристики: Сенсорное управление, светодиодное освещение образца; устройство для снятия статического заряда; скорость резки от 0,05 до 100 мм/с; механическая моторизованная подача образца; шаг для ультратонких срезов от 1 нм до 2,5 мкм; шаг для полутонких срезов от 2,5 до 15 мкм; поддержание индивидуальной температуры температуры образца, ножа, камеры от - 15°С до - 185°С; функция быстрого охлаждения, электронный контроль размораживания/сушки камеры.
  • Вакуумная препаративная установка «Крион», Оригинальная конструкция ИБК РАН на базе существенно модифицированного вакуумного поста JEE-4C (JEOL, Япония)
    Прменение: приготовления образцов с использованием низкотемпературных технологий методами реплик; методы замораживания-скалывания, замораживания-скалывания-травления. В комплект установки входят: 2 термоэмиссионных пушки с ускоряющим напряжение ~7 Кв для напыления металлов и углерода под изменяемыми углами; поворотный столик для кругового оттенения.
  • Вакуумная напылительная установка JEE-4X (JEOL, Япония).
    Прменение: Укрепление полимерных пленок-подложек аморфным углеродом, нанесение металлических покрытий на образец.
    • Установка обработки материалов в тлеющем разряде Pelco easiGlow (TeddPella, США).
      Прменение: Гидрофилизация гидрофобных поверхностей, сеточек (пленок-подложек укрепленных углеродом), создание положительного или отрицательно заряженных сеточек для нанесения образца с известными свойствами.
    • Установка для производства жидкого азота LNP-240Cryomech (США).
    • Станок для приготовления стеклянных ножей для ультрамикротомии KnifeMaker 7801A LKB (Швеция)
    • Набор приспособлений для получения тонких пленок
      Применение: приготовление тонких полимерных пленок-подложек.
    • Приборы, приспособления и инструменты для проведения химической фиксации путем перфузии
      Применение: проведение перфузионных процедур.

    Дополнительные сведения об оборудовании, включая подробные характеристики приборов, наименование производителя, год выпуска и
    сведения о метрологическом обеспечении доступны по ссылке Оборудование ЦКП на основной странице ЦКП ПНЦБИ РАН в разделе Документы регламентирующие деятельность ЦКП.

Журнал загрузки основного оборудования

      Журнал загрузки JEM-1400+         Бронирование времени работы на приборе         Инструкция по бронированию

Журналы загрузки вспомогательного оборудования

      1200EX/ запись         Axio Imager М1/ запись         Leica EM UC6/ запись         Reichert Om U2/ запись        

      Вакуумная установка JEE-X4/ запись         Крион/ запись                


Подать заявку

        On-line форма заявки       Статус поданных заявок       Помощь в заполнении заявки      

Как сослаться на ЦКП в публикации?

    В публикациях в разделе принадлежности авторов к организации (Affiliations) или
    в разделе благодарностей (Acknowledgments) можно указать один из следующих вариантов:
        - Electron Microscopy Core Facilities at ICB RAS (http://www.ckp-rf.ru/ckp/670266/);
        - Electron Microscopy Core Facilities of the Pushchino Center of Biological Research (http://www.ckp-rf.ru/ckp/670266/);
        - Сектор электронной микроскопии ЦКП ПНЦБИ РАН (№670266, http://www.ckp-rf.ru/ckp/670266/).

{jcomments off}